Version 2.80

Part Description

LP269180-8   Fungal 18s rRNA gene
The fungal 18S rRNA gene is approximately 1900 base pairs. It contains eight variable regions (V1-5 and V7-9) as well as one highly conserved region (V6). The highly conserved region can be used in molecular assays to detect the presence of fungal pathogens, and the variable regions can be used to identify specific species as well as for phylogenetic analysis. PMID: 2903154 Source: Regenstrief LOINC

Fully-Specified Name

Component
Fungal 18S rRNA gene
Property
PrThr
Time
Pt
System
Respiratory system specimen.lower
Scale
Ord
Method
Probe.amp.tar

Additional Names

Long Common Name
Fungal 18s rRNA gene [Presence] in Lower respiratory specimen by NAA with probe detection
Short Name
Fungal 18s rRNA gene L. Resp Ql NAA+probe
Display Name
Fungal 18s rRNA gene NAA+probe Ql (Lower resp)
Consumer Name Alpha Get Info
Fungal 18s RRNA gene, Lower respiratory

Example Answer List: LL744-4

Source: Regenstrief Institute
Answer Code Score Answer ID
Detected LA11882-0
Not detected LA11883-8

Basic Attributes

Class
MICRO
Type
Laboratory
First Released
Version 2.65
Last Updated
Version 2.77 (MAJ)
Change Reason
Release 2.77: SYSTEM: Updated to standardize the representation of "Respiratory system specimen" in the System subhierarchy across LOINC;
Order vs. Observation
Both

Member of these Panels

LOINC Long Common Name
94393-6 Respiratory pathogens DNA and RNA panel - Lower respiratory specimen by NAA with probe detection

Language Variants Get Info

Tag Language Translation
el-GR Greek (Greece) Μυκητιακό γονίδιο 18s rRNA:PrThr:Pt:Δείγμα αναπνευστικού συστήματος.κατώτερο:Ord:Ανιχνευτής.ενίσχυση.στόχου
Synonyms: PrThr Γονίδιο Μυκητιακό γονίδιο 18s rRNA
es-MX Spanish (Mexico) Gen de ARNr 18s fúngico:Presencia o umbral:Punto temporal:Muestra de vías respiratorias inferiores:Ordinal:Amplificación de ácidos nucleicos con detección de sonda
es-ES Spanish (Spain) Gen RNA 18s fúngico:PrThr:Punto temporal:Muestra de vías respiratorias inferiores:Ord:Sonda con amplificación dirigida
Synonyms: Muestra del tracto respiratorio Muestra respiratoria Tracto respiratorio
fr-FR French (France) Champignon ARNr gène 18S:Présence/Seuil:Ponctuel:Échantillon du système respiratoire inférieur:Qualitatif:PCR amplification de cible
it-IT Italian (Italy) Fungino, gene 18s rRNA:PrThr:Pt:Campione da Sistema Respiratorio.inferiore:Ord:Sonda.amp.tar
Synonyms: Campione da Apparato Respiratorio Campione da apparato respiratorio inferiore Gene 18s rRNA fungino Microbiologia Presenza o Soglia Punto nel tempo (episodio) Sonda con amplificazione Sonda con amplificazione del target Sonda di DNA
nl-NL Dutch (Netherlands) fungaal 18s rRNA-gen:aanwezigheid:moment:onderste luchtwegen:ordinaal:probe-detectie
Synonyms: onderste ademhalingsstelsel; systema respiratorium inferior probe.amp.tar systema respiratorium; ademhalingsstelsel
zh-CN Chinese (China) 真菌 18s rRNA 基因:存在情况或阈值:时间点:呼吸系统标本.下:序数型:探针法.基因扩增.靶向
Synonyms: Gen-Probe rRNA 探针法.扩增.靶向 下 下的 下部 低级 低级的 供检查用的材料;待检物;待试验物;样品;样本;试料;试样 依次型;分类顺序型;定性的;序数型（或称等级型）;性质上的;有序型;有序性分类应答;有序性分类结果;秩次型;等级型;筛查;顺序型 借助扩增的探针方法;借助扩增的探针法;探针法.扩增 借助靶向扩增的探针方法;借助靶向扩增的探针法;探针法.扩增.靶向 受检物 呼吸系统（呼吸道）标本.下;下呼吸系统标本;下呼吸道标本 呼吸道标本（样品、样本）;呼吸系统标本（样品、样本） 基因探针 存在情况;存在;存在与否;是否存在;阈值;界值;界限;阀值;临界值;存在情况（存在、存在与否、是否存在）或阈值（界值、界限、阀值、临界值） 微生物学;微生物学试验;微生物学试验（培养、DNA、抗原及抗体） 扩增型 扩增性 时刻;随机;随意;瞬间 样品 样本 核糖体 RNA 探针法.基因扩增.靶向 核糖体 RNA 探针法.扩增.靶向 核糖体核糖核酸 探针法.基因扩增.靶向 核糖体核糖核酸 探针法.扩增.靶向 核蛋白体 RNA 核蛋白体 RNA 探针法.基因扩增.靶向 核蛋白体 RNA 探针法.扩增.靶向 核蛋白体 RNA（Ribosomal RNA，RRNA） 核蛋白体核糖核酸 核醣体 RNA 经过扩增的 脱氧核糖核酸探针 试样 较低 较低的 遗传基因;遗传因子;吉恩;生物基因

LOINC Terminology Service (API) using HL7® FHIR® Get Info

CodeSystem lookup
https://fhir.loinc.org/CodeSystem/$lookup?system=http://loinc.org&code=91085-1